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重庆农业科学院是在原重庆农业科学院、重庆水果研究所、重庆作物研究所、重庆茶叶研究所和重庆农业机械研究所的基础上，经重庆市人民政府批准设立的公益性农业科研机构。其目标是建设西部一流的农业研究机构和全国先进的农业研究机构。是以总部为核心的永川粮食作物实验示范基地、永川茶叶实验示范基地、江津水果研究示范基地、黔江雾灵山农业综合实验站四个基地的创新平台。坚持建立科研院所、发展人才院所、服务强院战略，以机制创新为引擎，全面加强基础条件、学科体系、人才队伍、和谐农业科学院四大建设，提升科技创新和科技服务能力，努力建设集农业科研、示范、展示、培训、加工、物流为一体的农业科学院，示范重庆现代农业示范园区和山地农业科技创新中心。重庆农业科学院有8个职能办公室和15个研究所(中心)依托农业部农产品质量监督检验检测中心(重庆)、重庆重点农业实验室、重庆玉米工程技术研究中心、重庆茶叶工程技术研究中心、重庆种业(集团)有限公司、重庆金穗种业有限公司、重庆云岭茶业技术有限公司的成立重庆市农业科学院
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