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南方医科大学图书馆随学校创办而诞生、随学校的变迁而变迁，现有校本部和顺德两个馆区，总建筑面积44661平方米，实行藏、借、阅一体化的管理和服务模式，两个馆区拥有阅览座位4700个，研讨室40余间，读者用机180台，周开放时间达到98小时，考试月期间更达到105小时。截至2021年1月，图书馆文献资源累积量477万册；拥有SCIE、Science、Nature、JAMA、NEJM、Lancet，BMJ等世界权威综合医学杂志、各医学学科外文核心期刊、电子图书、实验室指南、临床医师考试题库及手术视频、解剖图谱等数据库；自建了南医院士文库、南医学位论文库、南医专业课程电子教材库、南医机构知识库和学科资源网等，形成了以生物医学文献为重点，涵盖文、史、哲、政、经、法、教育、管理等学科的馆藏资源体系，基本实现了馆藏资源数字化的建设目标。
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